Secuencia final alternativa: Completa el juego con un ranking A, S o SS.
Todos los power-ups en el minijuego Zoradius: Mientras disputes una partida de Zoradius pausa el juego y pulsa:
Diferentes imagenes despues de los creditos: Termina el juego con rango A para ver una imagen especial que incluye a Dingo y sus amigos en la pantalla Result Screen despues de los creditos.
Fondos distintos en extra mission: Una vez hayas completado todas las misiones con el record mas alto, el fondo negro sera reemplazado por una ilusion de Yoji Shinkawa en la que se ven los bocetos del diseño de Jehuty.
Aumaan Anubis en versus: Termina el juego una vez y empieza una nueva partida con todas las subarmas equipadas. Intenta introducirte dentro de Margrifier, el lugar donde tienes que desbloquear el puente. Si sigues siempre en la ruta de la izquierda, llegaras a un callejon en tu camino a casa hacia el generador. Usa Vector Cannon para destruir las piedras que bloquean la zona y descubriras un camino secreto, llamado Wind Tunnel. Alli pelearas con un monton de enemigos, destruyelos a todos y llegaras a un lugar desconocido, donde pelearas con Aumaan Anubis. Derrotale y encontraras un pequeño icono con su figura, cogelo.
Camino alternativo para el minijuego Zoraius: Acaba el juego. Con esto conseguiras el modo Misiones Extra que contiene la opcion Combate contra Jefes. Una vez aqui, lucha contra el bueno de Leo y pulsa: . El minijuego de Zoradius sera desbloqueable la proxima vez que vayas a la opcion de Misiones Extra.