Fase de bonus de Duskull: Esta fase aparece aleatoriamente tras capturar tres Pokemon, en el agujero de la mesa Zafiro. Los Duskull se mueven por el cementerio de dos en dos. Tienes que golpearlos antes de que desaparezcan. Hay 25 en total. Tienes que vencerlos rapidamente, pues tras ellos aparece un Dusclops y tienes que golpearlo cinco veces. Puedes retener tu bola por unos segundos, asi que ten cuidado. Al vencer consigues 30 millones de puntos.
Fase de bonus de Groudon: Accede al agujero correspondiente despues de evolucionar un Pokemon, capturar o hacer eclosionar a tres Pokemon. Esta fase solo esta en la mesa Rubi.
Fase de bonus de Kyogre: Accede al agujero correspondiente despues de evolucionar un Pokemon, capturar o hacer eclosionar a tres Pokemon. Esta fase solo esta en la mesa Zafiro.
Fase de bonus de Rayquaza: Accede al agujero despues de evolucionar un Pokemon, capturar o hacer eclosionar a tres Pokemon. Esta fase se ecuentra en las dos mesas.
Jirachi: Entra en el Area de las Ruinas y usa la tragaperras hasta que te salga la opcion de Jirachi Arrival. Ahora tendras que atrapar a Jirachi en 30 segundos. Si lo haces recibiras muchos puntos.
Localización de los pokemón: Estan puestos en el orden en el que aparecen en la Pokedex: Treecko: Bosque de mesa Rubi.
Torchic: Volcan de mesa Rubi.
Mudkip: Lago de mesa Zafiro.
Poochyena: Llanuras de mesas Rubi y Zafiro.
Zigzagoon: Bosque de mesa Zafiro.
Wormple: Tras eclosionar de un huevo. Trucoteca.com Trucos POKEMON PINBALL 3b3f - Anticopy
Silcoon: Bosque de mesas Rubi y Zafiro.
Cascoon: Bosque de mesas Rubi y Zafiro.
Lotad: Tras eclosionar de un huevo.
Lombre: Lago Zafiro.
Ludicolo: Consigue 3 piedras de agua en modo EVO para Lombre.
Seedot: Tras eclosionar de un huevo.
Nuzleaf: Mesa Rubi.
Shiftry: Consigue tres piedras hoja en modo EVO para Nuzleaf.
Tailwow: Llanuras de mesa Rubi.
Wingull: Oceano de mesas Rubi y Zafiro.
Ralts: Tras eclosionar de un huevo.
Surskit: Trucoteca.com Trucos POKEMON PINBALL 3b3f - Anticopy Tras eclosionar de un huevo.
Shroomish: Tras eclosionar de un huevo.
Slakoth: Bosque de mesas Rubi y Zafiro.
Abra: Cueva de mesa Rubi.
Alakazam: Consigue tres cables Link en modo EVO para Kadabra.